农业害虫病原真菌基因功能研究pdf

第一章导论

11研究背景

12研究现状

121真菌侵染过程的研究

122真菌产生代谢物的研究

123侵染后的宿主防御研究

124相互作用的三级程度研究

125被侵染的昆虫致死性行为变化研究

126昆虫病原菌的传播方式研究

127昆虫宿主-病原菌模型的遗传多样性研究现状

128昆虫病原真菌的流行病学研究

129建模

1210控制潜力

1211毒力基因与非毒力基因

13研究技术路线

第二章基因功能的实验研究过程

21载体结构

22质粒的扩大培养与提取（以天根质粒提取试剂盒为例）

23质粒酶切

24回收酶切质粒（OMEGA凝胶回收试剂盒）

25目的基因的寻找与电子PCR

26酶切位点分析

27引物设计和接头添加

28PCR扩增

29上样电泳

210PCR产物回收

211酶切质粒回收物和PCR纯化产物的连接

212感受态大肠杆菌转化

213阳性克隆鉴定

214靶基因的下游片段重组

215重组完整的质粒电转到农杆菌

216农杆菌侵染目标真菌

217真菌转化子培养与PCR验证

2171真菌转化子培养与PCR验证过程

2172微量DNA提取试剂配方

218真菌转化子的Southern Blotting杂交验证

2181真菌基因组DNA提取

2182Southern Blotting杂交操作

第三章基因功能的生物信息学研究

31Motif的分析与再现

311序列下载

312Motif分析

313Motif分析再现

314MEME的应用

32Motif的批量分析方法

321文件准备

322导入数据与设置

323细节调整与文件保存

324空间位置大小调节

325文本设置

326其他

33多基因组比对和共线性分析Mauve软件

34蛋白质三维结构预测（SWISS-MODEL）

35同源性分析—进化树构建

351Mega软件构建进化树

352clustalx与Mega联合构建进化树

353在线比对与Mega联合构建进化树

354构建系统发育树需要注意的问题

355系统发育树的美化

36小RNA分析方法

361数据下载

362mRNA差异表达

363lncRNA差异表达

364miRNA差异表达

365ceRNA网络构建

37基因编码蛋白的二级结构预测

371PSIPRED Workbench在线预测

372COILS在线预测卷曲结构

373Jpred4在线预测

374scratchproteomics在线预测

375Predict Protein在线预测

376信号肽的在线预测

38蛋白质的物理化学性质预测

39基因的模体识别与解析

310蛋白结构的可视化

311基因的富集信号通路分析

312分子对接分析

3121分子对接的基础

3122Chimera软件分子对接过程

3123分子对接细节展示

3124分子对接结果平面化

313蛋白活性口袋的预测

314antiSMASH数据库—微生物次生代谢物合成基因簇查询和

预测

315蛋白的多级构比对分析

316Circos在线绘图

第四章蝗绿僵菌微管蛋白（β-tubulin）基因的功能

41研究背景

42研究的内容

43实验材料

431主要仪器设备

432主要试剂和培养基

44实验方法

441菌株和培养条件

442生物信息学分析

443真菌基因组DNA和RNA提取

444荧光染色及观察

445Southern blotting

446载体构建及转化子的获得

447孢子和虫菌体的计数

448产孢量的测定

449昆虫生测

4410PCR扩增程序和条件

4411数据处理

45结果分析

451蝗绿僵菌β-tubulin基因的生物信息学分析

452蝗绿僵菌目标基因β-tubulin基因敲除和回复转化子的

验证

453蝗绿僵菌β-tubulin基因对菌落形态和菌丝形态的

影响

454蝗绿僵菌β-tubulin基因对毒力的影响

455蝗绿僵菌β-tubulin基因对产孢的影响

456蝗绿僵菌β-tubulin基因对侵染结构附着胞的影响

457蝗绿僵菌β-tubulin基因在细胞核事件中的功能

46讨论

第五章蝗绿僵菌MaPpt1负调控微循环产孢和紫外抗性

51研究背景

52研究内容和技术路线

521研究内容

522研究技术路线

53实验材料

531主要仪器设备

532主要试剂和培养基

54实验方法

541菌株和培养条件

542生物信息学分析

543真菌基因组DNA和RNA提取

544荧光染色及观察

545Southern blotting

546载体构建及转化子的获得

547孢子和虫菌体的计数

548产孢量的测定

549昆虫生测

5410RNA的提取和定量分析

5411磷酸化蛋白质组学分析

5412数据处理

55结果分析

551蝗绿僵菌MaPpt1基因的生物信息学分析

552蝗绿僵菌MaPpt1目标基因的敲除和回复菌株的

构建

553蝗绿僵菌MaPpt1对菌落表型的影响

554蝗绿僵菌MaPpt1对产孢量的影响

555蝗绿僵菌MaPpt1对紫外逆境抗性的影响

556蝗绿僵菌中MaPpt1在湿热逆境中的作用和表达模式的

分析

557MaPpt1在紫外和湿热逆境中的作用

558蝗绿僵菌MaPpt1在不同培养基上对产孢的影响

559蝗绿僵菌MaPpt1对毒力的影响

5510蝗绿僵菌MaPpt1调控的信号途径材料的选择及RNA

质量评估

5511蝗绿僵菌MaPpt1 基因的敲除改变了产孢的信号

途径

5512蛋白质组学分析MaPpt1在产孢和UV抗性的作用

机制

5513MaPpt1调控的基因网络

56讨论

第六章主要结论与展望

附录

AqRT-PCR数字表达谱验证结果

B蛋白质组学分析结果

C蛋白质组学质谱图

D缩略词

E常用色素配制及使用方法

F常用抗生素配制及使用方法

G常用培养基

H常用试剂配制方法

I常用酸碱指示剂及变化范围

J常用生物鉴定引物

ISBN：9787518995707

作者：张杰

出版社：科学技术文献出版社

出版日期：2024-05-08

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